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本所林诗舜教授研究植物病毒如何干扰植物 RNA 静默 (RNA silencing) 机制的研究 16 年，已被 Nature Communications 所接受。RNA silencing 是植物抵抗病毒的重要防线。病毒为了抵抗这样的防御机制特化出病毒抑制子 (viral suppressor) 来抑制 RNA silencing。林老师长期以芜菁嵌纹病毒 (turnip mosaic virus; TuMV) 为模式病毒及 Arabidopsis 为模式植物来进行研究。他发现 TuMV 的病毒抑制子 (HC-ProTu) 具有很强的抑制 RNA silencing pathway 其中一个重要的元件蛋白 HEN1 甲基化转移酶的活性，导致产生许多未甲基化微型核酸 (unmethylated microRNA; unMet-miRNAs) 产生。然而长期以来，科学界一直认为 HC-ProTu 是单纯的透过结合 miRNAs，阻止 miRNA 进入 AGO1 (另一个 RNA silencing 的重要元件蛋白)，导致 RNA silencing suppression 的产生。因此林老师如果要推翻长期根深蒂固的学说，他需要用更多的时间与证据来证明 HC-ProTu 有额外的 RNA silencing suppression 能力。
从林教授 2008 年加入台大生技所开始这个研究，历经了许多的研究生，前仆后继，契而不舍的研究，团队发现 HC-ProTu 抑制 HEN1 的能力比其他种类病毒的 HC-Pro [例如矮南瓜黄化嵌纹病毒 (zucchini yellow mosaic virus; ZYMV) 的 HC-Pro (HC-ProZy)] 还强。HC-ProTu 可以抑制 50% HEN1 的活性；而 HC-ProZy 则只能抑制 20% 甲基化活性。证实不同的 potyviruses 对于抑制植物 HEN1 活性的需求不同。
此外研究团队发现，当 unMet-miRNAs 进入 AGO1 时，所形成的 unMet-miRNA-AGO1 复合体会被 HESO1 所辨识，触发了细胞自噬作用 (autophagy) 降解 unMet-miRNA-AGO1 复合体。也因为如此，HC-ProTu 所造成的植物体内的 AGO1 不稳定现象比 HC-ProZy 还严重。而转录体大数据也证实 HC-ProTu 抑制 RNA silencing 能力确实比 HC-ProZy 好。
然而在投稿 Nature Communications 的过程，受到了一位 autophagy 专家的强烈质疑文章中 autophagic AGO1 降解的理论。为回答这审查者的质疑，团队另外花了两年的时间补做许多数据，特别是由台大生农院共仪中心电显室及中研院电显室共同协助，取得关键数据。由免疫电显数据看到 HC-ProTu、ATG8a (autophagy marker) 及 AGO1 共同落在细胞自噬体 (autophagosome) 的重要证据。也正因这个证据，Nature Communications 于 2024 年 12 月接受了该团队的研究成果。
林教授多年专注研究，突破重重挑战，终于证实 HC-ProTu 新能力，并获得国际顶尖期刊的肯定。这不仅是对植物病毒学研究的一大进展，也展现了坚持与团队合作的力量。面对专家严苛的质疑，团队选择迎难而上，补充实验，以严谨的数据说服审查者，最终成功改写了传统学说。这也鼓励我们，科学探索需要时间、毅力与勇于挑战权威的精神。展望未来，这项研究能激励更多年轻学者投入植物科学探索，坚持以创新的视角解决未解之谜，也期盼 RNA silencing 机制的深入研究能为农业抗病毒育种带来突破性贡献。无论面对多大的困难，只要怀抱信念与初心，终将能在科学道路上看见光亮与希望。
本期刊论文之官方连结: https://www.nature.com/articles/s41467-025-56320-z?utm_source=rct_congratemailt&utm_medium=email&utm_campaign=oa_20250313&utm_content=10.1038/s41467-025-56320-z
相关连结: https://www.asiaresearchnews.com/content/battle-between-resilient-plants-and-cunning-viruses-strategies-attack-and-defense
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